data_D17
# 
_chem_comp.id                                    D17 
_chem_comp.name                                  "N-({3-[({4-[(Z)-(4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidin-5-ylidene)methyl]phenyl}amino)methyl]phenyl}carbonyl)-L-glutamic acid" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C23 H21 N3 O6 S2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2009-05-28 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-06-04 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        499.559 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     D17 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        2WJP 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  EBI 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
D17 OE1  OE1  O 0 1 N N N 0.366  38.238 116.875 -10.179 1.236  -0.473 OE1  D17 1  
D17 CD   CD   C 0 1 N N N 1.181  38.308 115.950 -9.246  1.945  -0.768 CD   D17 2  
D17 OE2  OE2  O 0 1 N N N 1.387  37.492 114.996 -9.427  2.978  -1.606 OE2  D17 3  
D17 CG   CG   C 0 1 N N N 1.820  39.709 115.909 -7.881  1.673  -0.190 CG   D17 4  
D17 CB   CB   C 0 1 N N N 3.245  39.714 115.454 -7.951  0.454  0.731  CB   D17 5  
D17 CA   CA   C 0 1 N N S 4.118  40.451 116.464 -6.565  0.177  1.318  CA   D17 6  
D17 C    C    C 0 1 N N N 5.549  40.253 116.086 -6.658  -0.946 2.319  C    D17 7  
D17 OXT  OXT  O 0 1 N N N 5.735  39.786 114.935 -7.448  -0.820 3.397  OXT  D17 8  
D17 O    O    O 0 1 N N N 6.281  40.127 117.082 -6.022  -1.959 2.150  O    D17 9  
D17 N    N    N 0 1 N N N 3.793  41.849 116.824 -5.646  -0.202 0.242  N    D17 10 
D17 CAU  CAU  C 0 1 N N N 4.471  42.951 116.514 -4.320  -0.008 0.389  CAU  D17 11 
D17 OBC  OBC  O 0 1 N N N 5.275  43.077 115.595 -3.888  0.482  1.413  OBC  D17 12 
D17 CAT  CAT  C 0 1 Y N N 4.029  44.176 117.305 -3.393  -0.391 -0.697 CAT  D17 13 
D17 CAQ  CAQ  C 0 1 Y N N 2.805  44.164 117.971 -2.019  -0.191 -0.549 CAQ  D17 14 
D17 CAS  CAS  C 0 1 Y N N 4.862  45.291 117.323 -3.886  -0.958 -1.873 CAS  D17 15 
D17 CAR  CAR  C 0 1 Y N N 4.450  46.396 118.055 -3.015  -1.314 -2.882 CAR  D17 16 
D17 CAP  CAP  C 0 1 Y N N 3.248  46.369 118.751 -1.655  -1.109 -2.730 CAP  D17 17 
D17 CAO  CAO  C 0 1 Y N N 2.402  45.269 118.710 -1.159  -0.551 -1.565 CAO  D17 18 
D17 CAN  CAN  C 0 1 N N N 1.116  45.204 119.543 0.324   -0.336 -1.407 CAN  D17 19 
D17 NAY  NAY  N 0 1 N N N 0.419  46.511 119.553 0.928   -1.527 -0.804 NAY  D17 20 
D17 CAA  CAA  C 0 1 Y N N -0.029 47.110 118.438 2.298   -1.564 -0.559 CAA  D17 21 
D17 CAC  CAC  C 0 1 Y N N 0.006  46.472 117.193 2.870   -2.696 0.014  CAC  D17 22 
D17 CAE  CAE  C 0 1 Y N N -0.415 47.143 116.041 4.219   -2.737 0.257  CAE  D17 23 
D17 CAB  CAB  C 0 1 Y N N -0.563 48.401 118.528 3.092   -0.470 -0.892 CAB  D17 24 
D17 CAG  CAG  C 0 1 Y N N -1.041 49.038 117.378 4.442   -0.502 -0.653 CAG  D17 25 
D17 CAF  CAF  C 0 1 Y N N -0.900 48.453 116.119 5.021   -1.637 -0.071 CAF  D17 26 
D17 CAH  CAH  C 0 1 N N N -1.281 49.112 114.940 6.465   -1.675 0.189  CAH  D17 27 
D17 CAI  CAI  C 0 1 N N N -1.377 50.474 114.718 7.169   -0.518 0.284  CAI  D17 28 
D17 SBG  SBG  S 0 1 N N N -1.230 51.753 115.867 6.542   1.142  0.315  SBG  D17 29 
D17 CAL  CAL  C 0 1 N N N -1.527 53.025 114.718 8.141   1.895  0.450  CAL  D17 30 
D17 SBH  SBH  S 0 1 N N N -1.587 54.621 115.066 8.474   3.572  0.544  SBH  D17 31 
D17 NAX  NAX  N 0 1 N N N -1.710 52.499 113.492 9.038   0.902  0.466  NAX  D17 32 
D17 CAK  CAK  C 0 1 N N N -1.617 51.091 113.458 8.623   -0.352 0.392  CAK  D17 33 
D17 OBE  OBE  O 0 1 N N N -1.741 50.502 112.391 9.390   -1.297 0.408  OBE  D17 34 
D17 HE2  HE2  H 0 1 N N N 0.794  36.754 115.076 -10.321 3.115  -1.948 HE2  D17 35 
D17 HG1C HG1C H 0 0 N N N 1.238  40.328 115.210 -7.177  1.478  -0.999 HG1C D17 36 
D17 HG2C HG2C H 0 0 N N N 1.810  40.097 116.938 -7.549  2.540  0.380  HG2C D17 37 
D17 HB1C HB1C H 0 0 N N N 3.598  38.677 115.359 -8.656  0.649  1.539  HB1C D17 38 
D17 HB2C HB2C H 0 0 N N N 3.310  40.225 114.482 -8.284  -0.414 0.161  HB2C D17 39 
D17 HA   HA   H 0 1 N N N 3.880  39.979 117.429 -6.195  1.075  1.813  HA   D17 40 
D17 H    H    H 0 1 N N N 2.963  41.982 117.366 -5.992  -0.592 -0.576 H    D17 41 
D17 HXT  HXT  H 0 1 N N N 6.550  39.297 114.919 -7.475  -1.567 4.010  HXT  D17 42 
D17 HAQ  HAQ  H 0 1 N N N 2.168  43.294 117.912 -1.631  0.244  0.360  HAQ  D17 43 
D17 HAS  HAS  H 0 1 N N N 5.798  45.296 116.785 -4.947  -1.119 -1.992 HAS  D17 44 
D17 HAR  HAR  H 0 1 N N N 5.067  47.282 118.084 -3.395  -1.753 -3.792 HAR  D17 45 
D17 HAP  HAP  H 0 1 N N N 2.964  47.228 119.341 -0.978  -1.389 -3.523 HAP  D17 46 
D17 HAN1 HAN1 H 0 0 N N N 0.447  44.447 119.108 0.771   -0.156 -2.384 HAN1 D17 47 
D17 HAN2 HAN2 H 0 0 N N N 1.382  44.942 120.578 0.499   0.526  -0.763 HAN2 D17 48 
D17 HAY  HAY  H 0 1 N N N -0.393 46.370 120.119 0.374   -2.289 -0.577 HAY  D17 49 
D17 HAC  HAC  H 0 1 N N N 0.361  45.454 117.122 2.251   -3.544 0.266  HAC  D17 50 
D17 HAB  HAB  H 0 1 N N N -0.606 48.904 119.483 2.645   0.405  -1.340 HAB  D17 51 
D17 HAE  HAE  H 0 1 N N N -0.365 46.646 115.083 4.662   -3.616 0.702  HAE  D17 52 
D17 HAG  HAG  H 0 1 N N N -1.527 49.998 117.466 5.057   0.347  -0.911 HAG  D17 53 
D17 HAH1 HAH1 H 0 0 N N N -1.530 48.477 114.102 6.968   -2.624 0.304  HAH1 D17 54 
D17 HAX  HAX  H 0 1 N N N -1.895 53.054 112.681 9.984   1.100  0.535  HAX  D17 55 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
D17 OE1 CD   DOUB N N 1  
D17 CD  OE2  SING N N 2  
D17 CD  CG   SING N N 3  
D17 CG  CB   SING N N 4  
D17 CB  CA   SING N N 5  
D17 CA  C    SING N N 6  
D17 CA  N    SING N N 7  
D17 C   OXT  SING N N 8  
D17 C   O    DOUB N N 9  
D17 N   CAU  SING N N 10 
D17 CAU OBC  DOUB N N 11 
D17 CAU CAT  SING N N 12 
D17 CAT CAQ  SING Y N 13 
D17 CAT CAS  DOUB Y N 14 
D17 CAQ CAO  DOUB Y N 15 
D17 CAS CAR  SING Y N 16 
D17 CAR CAP  DOUB Y N 17 
D17 CAP CAO  SING Y N 18 
D17 CAO CAN  SING N N 19 
D17 CAN NAY  SING N N 20 
D17 NAY CAA  SING N N 21 
D17 CAA CAC  SING Y N 22 
D17 CAA CAB  DOUB Y N 23 
D17 CAC CAE  DOUB Y N 24 
D17 CAE CAF  SING Y N 25 
D17 CAB CAG  SING Y N 26 
D17 CAG CAF  DOUB Y N 27 
D17 CAF CAH  SING N N 28 
D17 CAH CAI  DOUB N N 29 
D17 CAI SBG  SING N N 30 
D17 CAI CAK  SING N N 31 
D17 SBG CAL  SING N N 32 
D17 CAL SBH  DOUB N N 33 
D17 CAL NAX  SING N N 34 
D17 NAX CAK  SING N N 35 
D17 CAK OBE  DOUB N N 36 
D17 OE2 HE2  SING N N 37 
D17 CG  HG1C SING N N 38 
D17 CG  HG2C SING N N 39 
D17 CB  HB1C SING N N 40 
D17 CB  HB2C SING N N 41 
D17 CA  HA   SING N N 42 
D17 N   H    SING N N 43 
D17 OXT HXT  SING N N 44 
D17 CAQ HAQ  SING N N 45 
D17 CAS HAS  SING N N 46 
D17 CAR HAR  SING N N 47 
D17 CAP HAP  SING N Z 48 
D17 CAN HAN1 SING N N 49 
D17 CAN HAN2 SING N N 50 
D17 NAY HAY  SING N N 51 
D17 CAC HAC  SING N N 52 
D17 CAB HAB  SING N N 53 
D17 CAE HAE  SING N N 54 
D17 CAG HAG  SING N N 55 
D17 CAH HAH1 SING N N 56 
D17 NAX HAX  SING N N 57 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
D17 SMILES           ACDLabs              10.04 "O=C1C(\SC(=S)N1)=C\c3ccc(NCc2cc(C(=O)NC(C(=O)O)CCC(=O)O)ccc2)cc3" 
D17 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.352 "OC(=O)CC[C@H](NC(=O)c1cccc(CNc2ccc(cc2)\C=C3/SC(=S)NC3=O)c1)C(O)=O" 
D17 SMILES           CACTVS               3.352 "OC(=O)CC[CH](NC(=O)c1cccc(CNc2ccc(cc2)C=C3SC(=S)NC3=O)c1)C(O)=O" 
D17 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "c1cc(cc(c1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)CNc2ccc(cc2)\C=C/3\C(=O)NC(=S)S3" 
D17 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "c1cc(cc(c1)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O)CNc2ccc(cc2)C=C3C(=O)NC(=S)S3" 
D17 InChI            InChI                1.03  
"InChI=1S/C23H21N3O6S2/c27-19(28)9-8-17(22(31)32)25-20(29)15-3-1-2-14(10-15)12-24-16-6-4-13(5-7-16)11-18-21(30)26-23(33)34-18/h1-7,10-11,17,24H,8-9,12H2,(H,25,29)(H,27,28)(H,31,32)(H,26,30,33)/b18-11-/t17-/m0/s1" 
D17 InChIKey         InChI                1.03  ISIOCNFLEMFKTN-PBXDPIQXSA-N 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
D17 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              10.04 "N-({3-[({4-[(Z)-(4-oxo-2-thioxo-1,3-thiazolidin-5-ylidene)methyl]phenyl}amino)methyl]phenyl}carbonyl)-L-glutamic acid"                   
D17 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "(2S)-2-[[3-[[[4-[(Z)-(4-oxo-2-sulfanylidene-1,3-thiazolidin-5-ylidene)methyl]phenyl]amino]methyl]phenyl]carbonylamino]pentanedioic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
D17 "Create component"     2009-05-28 EBI  
D17 "Modify aromatic_flag" 2011-06-04 RCSB 
D17 "Modify descriptor"    2011-06-04 RCSB 
# 
