data_EVT
# 
_chem_comp.id                                    EVT 
_chem_comp.name                                  "(2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C26 H46 N2 O8" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2018-04-25 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2024-09-27 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        514.652 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     EVT 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   Y 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        6GDZ 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  EBI 
_chem_comp.pdbx_pcm                              Y 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
EVT C7   C1  C 0 1 N N N N N N -23.948 17.714 9.890  6.280   0.324  -0.388 C7   EVT 1  
EVT C9   C2  C 0 1 N N N N N N -25.448 17.771 10.038 4.977   0.837  0.169  C9   EVT 2  
EVT C10  C3  C 0 1 N N N N N N -26.149 16.794 9.059  4.916   2.357  0.005  C10  EVT 3  
EVT C11  C4  C 0 1 N N S N N N -27.655 16.651 9.407  3.593   2.878  0.570  C11  EVT 4  
EVT C12  C5  C 0 1 N N N N N N -29.995 13.893 8.142  0.112   1.702  -0.503 C12  EVT 5  
EVT C13  C6  C 0 1 N N N N N N -31.440 13.539 8.596  -1.158  1.671  0.350  C13  EVT 6  
EVT C14  C7  C 0 1 N N N N N N -32.370 14.780 8.568  -2.319  1.127  -0.485 C14  EVT 7  
EVT O8   O1  O 0 1 N N N N N N -23.347 16.862 10.525 7.081   1.098  -0.869 O8   EVT 8  
EVT C15  C8  C 0 1 N N N N N N -33.710 14.498 9.296  -3.589  1.096  0.368  C15  EVT 9  
EVT N6   N1  N 0 1 N N N N N N -23.312 18.595 9.084  6.558   -0.994 -0.346 N6   EVT 10 
EVT C16  C9  C 0 1 N N N N N N -34.611 15.760 9.328  -4.751  0.551  -0.467 C16  EVT 11 
EVT C17  C10 C 0 1 N N N N N N -35.913 15.526 10.135 -6.021  0.520  0.386  C17  EVT 12 
EVT C18  C11 C 0 1 N N N N N N -36.725 16.843 10.245 -7.182  -0.024 -0.448 C18  EVT 13 
EVT C19  C12 C 0 1 N N N N N N -38.034 16.695 11.066 -8.452  -0.055 0.404  C19  EVT 14 
EVT C20  C13 C 0 1 N N N N N N -37.780 16.256 12.535 -9.613  -0.600 -0.430 C20  EVT 15 
EVT C21  C14 C 0 1 N N N N N N -38.982 16.610 13.452 -10.883 -0.631 0.423  C21  EVT 16 
EVT C22  C15 C 0 1 N N N N N N -38.723 16.186 14.923 -12.044 -1.176 -0.412 C22  EVT 17 
EVT C23  C16 C 0 1 N N N N N N -28.352 17.981 9.276  3.584   4.384  0.521  C23  EVT 18 
EVT O24  O2  O 0 1 N N N N N N -28.445 18.492 8.129  2.736   4.963  -0.116 O24  EVT 19 
EVT N25  N2  N 0 1 N N N N N N -28.339 15.685 8.551  2.481   2.357  -0.228 N25  EVT 20 
EVT C26  C17 C 0 1 N N N N N N -29.315 14.888 9.053  1.255   2.239  0.319  C26  EVT 21 
EVT O26  O3  O 0 1 N N N N N N -28.815 18.525 10.315 4.518   5.083  1.185  O26  EVT 22 
EVT O27  O4  O 0 1 N N N N N N -29.668 14.933 10.221 1.073   2.564  1.473  O27  EVT 23 
EVT C29  C18 C 0 1 N N N N N N -39.854 16.678 15.868 -13.314 -1.207 0.441  C29  EVT 24 
EVT C30  C19 C 0 1 N N N N N N -39.560 16.419 17.372 -14.476 -1.751 -0.394 C30  EVT 25 
EVT C31  C20 C 0 1 N N N N N N -39.734 14.934 17.779 -15.746 -1.782 0.459  C31  EVT 26 
EVT C32  C21 C 0 1 N N N N N N -39.334 14.703 19.259 -16.907 -2.327 -0.375 C32  EVT 27 
EVT C33  C22 C 0 1 N N N N N N -19.258 20.238 6.616  8.808   -3.865 1.953  C33  EVT 28 
EVT O34  O5  O 0 1 N N N N N N -19.056 19.626 5.580  8.845   -4.887 1.310  O34  EVT 29 
EVT C35  C23 C 0 1 N N N N N N -19.757 19.464 7.817  8.452   -2.564 1.281  C35  EVT 30 
EVT C36  C24 C 0 1 N N N N N N -21.301 19.520 7.904  8.186   -2.814 -0.205 C36  EVT 31 
EVT C37  C25 C 0 1 N N S N N N -21.852 18.601 9.032  7.825   -1.493 -0.888 C37  EVT 32 
EVT C38  C26 C 0 1 N N N N N N -21.345 19.028 10.386 7.683   -1.717 -2.371 C38  EVT 33 
EVT O39  O6  O 0 1 N N N N N N -20.960 18.137 11.191 8.725   -2.175 -3.083 O39  EVT 34 
EVT O40  O7  O 0 1 N N N N N N -21.330 20.257 10.661 6.633   -1.483 -2.920 O40  EVT 35 
EVT H93  H1  H 0 1 N N N N N N -25.790 18.795 9.828  4.147   0.380  -0.368 H93  EVT 36 
EVT H92  H2  H 0 1 N N N N N N -25.717 17.499 11.069 4.909   0.583  1.227  H92  EVT 37 
EVT H103 H3  H 0 0 N N N N N N -25.668 15.807 9.128  5.746   2.815  0.543  H103 EVT 38 
EVT H102 H4  H 0 0 N N N N N N -26.051 17.179 8.033  4.984   2.611  -1.053 H102 EVT 39 
EVT H11  H5  H 0 1 N N N N N N -27.730 16.320 10.453 3.484   2.548  1.604  H11  EVT 40 
EVT H122 H6  H 0 0 N N N N N N -29.398 12.970 8.124  0.348   0.693  -0.839 H122 EVT 41 
EVT H123 H7  H 0 0 N N N N N N -30.041 14.320 7.129  -0.047  2.346  -1.368 H123 EVT 42 
EVT H133 H8  H 0 0 N N N N N N -31.848 12.772 7.921  -0.999  1.028  1.215  H133 EVT 43 
EVT H132 H9  H 0 0 N N N N N N -31.405 13.143 9.622  -1.395  2.681  0.686  H132 EVT 44 
EVT H143 H10 H 0 0 N N N N N N -31.862 15.619 9.065  -2.478  1.770  -1.350 H143 EVT 45 
EVT H142 H11 H 0 0 N N N N N N -32.580 15.047 7.522  -2.083  0.117  -0.821 H142 EVT 46 
EVT H153 H12 H 0 0 N N N N N N -34.241 13.692 8.769  -3.431  0.452  1.233  H153 EVT 47 
EVT H152 H13 H 0 0 N N N N N N -33.497 14.183 10.328 -3.826  2.105  0.704  H152 EVT 48 
EVT H6   H14 H 0 1 N N N N N N -23.838 19.238 8.527  5.920   -1.612 0.042  H6   EVT 49 
EVT H163 H15 H 0 0 N N N N N N -34.050 16.585 9.791  -4.910  1.195  -1.332 H163 EVT 50 
EVT H162 H16 H 0 0 N N N N N N -34.877 16.032 8.296  -4.514  -0.458 -0.803 H162 EVT 51 
EVT H173 H17 H 0 0 N N N N N N -36.523 14.765 9.626  -5.862  -0.123 1.251  H173 EVT 52 
EVT H172 H18 H 0 0 N N N N N N -35.655 15.174 11.145 -6.257  1.530  0.723  H172 EVT 53 
EVT H183 H19 H 0 0 N N N N N N -36.094 17.602 10.730 -7.341  0.619  -1.314 H183 EVT 54 
EVT H182 H20 H 0 0 N N N N N N -36.986 17.177 9.230  -6.945  -1.034 -0.785 H182 EVT 55 
EVT H193 H21 H 0 0 N N N N N N -38.555 17.664 11.074 -8.293  -0.699 1.270  H193 EVT 56 
EVT H192 H22 H 0 0 N N N N N N -38.670 15.941 10.579 -8.688  0.954  0.741  H192 EVT 57 
EVT H203 H23 H 0 0 N N N N N N -37.620 15.168 12.560 -9.772  0.043  -1.295 H203 EVT 58 
EVT H202 H24 H 0 0 N N N N N N -36.881 16.768 12.910 -9.377  -1.609 -0.766 H202 EVT 59 
EVT H213 H25 H 0 0 N N N N N N -39.149 17.697 13.418 -10.724 -1.275 1.288  H213 EVT 60 
EVT H212 H26 H 0 0 N N N N N N -39.878 16.089 13.083 -11.120 0.379  0.759  H212 EVT 61 
EVT H223 H27 H 0 0 N N N N N N -38.668 15.089 14.974 -12.203 -0.532 -1.277 H223 EVT 62 
EVT H222 H28 H 0 0 N N N N N N -37.767 16.617 15.256 -11.808 -2.185 -0.748 H222 EVT 63 
EVT H25  H29 H 0 1 N N N N N N -28.086 15.611 7.587  2.628   2.096  -1.151 H25  EVT 64 
EVT H1   H30 H 0 1 N N N N N N -29.226 19.350 10.085 4.472   6.047  1.123  H1   EVT 65 
EVT H293 H31 H 0 0 N N N N N N -39.986 17.760 15.720 -13.156 -1.850 1.306  H293 EVT 66 
EVT H292 H32 H 0 0 N N N N N N -40.784 16.155 15.600 -13.551 -0.197 0.777  H292 EVT 67 
EVT H303 H33 H 0 0 N N N N N N -38.523 16.721 17.583 -14.634 -1.108 -1.259 H303 EVT 68 
EVT H302 H34 H 0 0 N N N N N N -40.249 17.030 17.974 -14.239 -2.761 -0.730 H302 EVT 69 
EVT H313 H35 H 0 0 N N N N N N -40.787 14.647 17.644 -15.587 -2.426 1.324  H313 EVT 70 
EVT H312 H36 H 0 0 N N N N N N -39.098 14.309 17.135 -15.982 -0.773 0.795  H312 EVT 71 
EVT H321 H37 H 0 0 N N N N N N -39.469 13.642 19.514 -17.066 -1.683 -1.241 H321 EVT 72 
EVT H323 H38 H 0 0 N N N N N N -38.280 14.983 19.402 -16.670 -3.336 -0.712 H323 EVT 73 
EVT H322 H39 H 0 0 N N N N N N -39.969 15.321 19.911 -17.812 -2.349 0.232  H322 EVT 74 
EVT H353 H41 H 0 0 N N N N N N -19.439 18.415 7.728  7.557   -2.148 1.745  H353 EVT 75 
EVT H352 H42 H 0 0 N N N N N N -19.328 19.901 8.731  9.278   -1.861 1.389  H352 EVT 76 
EVT H363 H43 H 0 0 N N N N N N -21.608 20.556 8.108  9.080   -3.230 -0.669 H363 EVT 77 
EVT H362 H44 H 0 0 N N N N N N -21.723 19.195 6.942  7.360   -3.517 -0.313 H362 EVT 78 
EVT H37  H45 H 0 1 N N N N N N -21.497 17.579 8.836  8.612   -0.762 -0.704 H37  EVT 79 
EVT H3   H46 H 0 1 N N N N N N -20.672 18.543 12.000 8.586   -2.303 -4.031 H3   EVT 80 
EVT OXT  O8  O 0 1 N Y N N N N ?       ?      ?      9.083   -3.888 3.267  OXT  EVT 81 
EVT H2   H47 H 0 1 N N N N N N ?       ?      ?      9.306   -4.745 3.654  H2   EVT 82 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
EVT O34 C33  DOUB N N 1  
EVT C33 C35  SING N N 2  
EVT C35 C36  SING N N 3  
EVT C36 C37  SING N N 4  
EVT O24 C23  DOUB N N 5  
EVT C12 C13  SING N N 6  
EVT C12 C26  SING N N 7  
EVT N25 C26  SING N N 8  
EVT N25 C11  SING N N 9  
EVT C14 C13  SING N N 10 
EVT C14 C15  SING N N 11 
EVT C37 N6   SING N N 12 
EVT C37 C38  SING N N 13 
EVT C26 O27  DOUB N N 14 
EVT C10 C11  SING N N 15 
EVT C10 C9   SING N N 16 
EVT N6  C7   SING N N 17 
EVT C23 C11  SING N N 18 
EVT C23 O26  SING N N 19 
EVT C15 C16  SING N N 20 
EVT C16 C17  SING N N 21 
EVT C7  C9   SING N N 22 
EVT C7  O8   DOUB N N 23 
EVT C17 C18  SING N N 24 
EVT C18 C19  SING N N 25 
EVT C38 O40  DOUB N N 26 
EVT C38 O39  SING N N 27 
EVT C19 C20  SING N N 28 
EVT C20 C21  SING N N 29 
EVT C21 C22  SING N N 30 
EVT C22 C29  SING N N 31 
EVT C29 C30  SING N N 32 
EVT C30 C31  SING N N 33 
EVT C31 C32  SING N N 34 
EVT C9  H93  SING N N 35 
EVT C9  H92  SING N N 36 
EVT C10 H103 SING N N 37 
EVT C10 H102 SING N N 38 
EVT C11 H11  SING N N 39 
EVT C12 H122 SING N N 40 
EVT C12 H123 SING N N 41 
EVT C13 H133 SING N N 42 
EVT C13 H132 SING N N 43 
EVT C14 H143 SING N N 44 
EVT C14 H142 SING N N 45 
EVT C15 H153 SING N N 46 
EVT C15 H152 SING N N 47 
EVT N6  H6   SING N N 48 
EVT C16 H163 SING N N 49 
EVT C16 H162 SING N N 50 
EVT C17 H173 SING N N 51 
EVT C17 H172 SING N N 52 
EVT C18 H183 SING N N 53 
EVT C18 H182 SING N N 54 
EVT C19 H193 SING N N 55 
EVT C19 H192 SING N N 56 
EVT C20 H203 SING N N 57 
EVT C20 H202 SING N N 58 
EVT C21 H213 SING N N 59 
EVT C21 H212 SING N N 60 
EVT C22 H223 SING N N 61 
EVT C22 H222 SING N N 62 
EVT N25 H25  SING N N 63 
EVT O26 H1   SING N N 64 
EVT C29 H293 SING N N 65 
EVT C29 H292 SING N N 66 
EVT C30 H303 SING N N 67 
EVT C30 H302 SING N N 68 
EVT C31 H313 SING N N 69 
EVT C31 H312 SING N N 70 
EVT C32 H321 SING N N 71 
EVT C32 H323 SING N N 72 
EVT C32 H322 SING N N 73 
EVT C35 H353 SING N N 74 
EVT C35 H352 SING N N 75 
EVT C36 H363 SING N N 76 
EVT C36 H362 SING N N 77 
EVT C37 H37  SING N N 78 
EVT O39 H3   SING N N 79 
EVT C33 OXT  SING N N 80 
EVT OXT H2   SING N N 81 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
EVT InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C26H46N2O8/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-22(29)27-20(25(33)34)16-18-23(30)28-21(26(35)36)17-19-24(31)32/h20-21H,2-19H2,1H3,(H,27,29)(H,28,30)(H,31,32)(H,33,34)(H,35,36)/t20-,21-/m0/s1" 
EVT InChIKey         InChI                1.03  JFNZOURGWMREOJ-SFTDATJTSA-N                                                                                                                                                                               
EVT SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C(O)=O"                                                                                                                                       
EVT SMILES           CACTVS               3.385 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[CH](CCC(=O)N[CH](CCC(O)=O)C(O)=O)C(O)=O"                                                                                                                                           
EVT SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)C(=O)O"                                                                                                                                       
EVT SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)NC(CCC(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O)C(=O)O"                                                                                                                                                 
# 
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id           EVT 
_pdbx_chem_comp_identifier.type              "SYSTEMATIC NAME" 
_pdbx_chem_comp_identifier.program           "OpenEye OEToolkits" 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version   2.0.6 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier        "(2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
EVT "Create component" 2018-04-25 EBI  
EVT "Initial release"  2018-06-20 RCSB 
EVT "Modify PCM"       2024-09-27 PDBE 
# 
_pdbx_chem_comp_pcm.pcm_id                             1 
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id                            EVT 
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id                LYS 
_pdbx_chem_comp_pcm.type                               None 
_pdbx_chem_comp_pcm.category                           Lipid/lipid-like 
_pdbx_chem_comp_pcm.position                           "Amino-acid side chain" 
_pdbx_chem_comp_pcm.polypeptide_position               "Any position" 
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id_linking_atom               C33 
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id_linking_atom   NZ 
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_specific_ptm_accession     ? 
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_generic_ptm_accession      ? 
# 
